Museo Arqueológico La Merced fue inaugurado en 1979 por los frailes que pertenecían al convento de Las Mercedes. En este lugar Fray Santos de Añasco y Sebastián de Belalcázar realizaron la primera misa en la que se bautizó a la ciudad como Santiago de Cali.
A lo largo de sus 32 años de labores esta institución ha propendido por la defensa, preservación y divulgación del patrimonio histórico prehispánico del suroccidente colombiano y